Table 1 Log-likelihood differences based on the concatenated alignment
From: Basal jawed vertebrate phylogeny inferred from multiple nuclear DNA-coded genes
| Â | Â | Â | P-values | Â | Â | |
|---|---|---|---|---|---|---|
Topology |  | Δ ln L i ± σ i | KH | AU | BPP | BP |
a ((((tp,lu),(((tl,(ga,bo)),st),bi)),ca),out) | (A, A) | ML | 0.59 | 0.88 | 0.89 | 0.44 |
b ((((tp,(((tl,(ga,bo)),st),bi)),lu),ca),out) | (A, A) | 2.08 ± 9.55 | 0.41 | 0.74 | 0.11 | 0.33 |
c (((tp,(lu,(((tl,(ga,bo)),st),bi))),ca),out) | (A, A) | 9.88 ± 7.57 | 0.10 | 0.14 | 0.00 | 0.02 |
d ((((tp,lu),((((tl,bo),ga),st),bi)),ca),out) | (A, B) | 16.6 ± 11.6 | 0.08 | 0.19 | 0.00 | 0.04 |
e ((((tp,lu),ca),(((tl,(ga,bo)),st),bi)),out) | (-, A) | 18.3 ± 13.1 | 0.09 | 0.21 | 0.00 | 0.03 |
f ((((tp,((((tl,bo),ga),st),bi)),lu),ca),out) | (A, B) | 18.6 ± 15.0 | 0.11 | 0.14 | 0.00 | 0.03 |
g (((tp,((((tl,(ga,bo)),st),bi),ca)),lu),out) | (-, A) | 22.0 ± 10.7 | 0.07 | 0.20 | 0.00 | 0.03 |
h (((tp,(lu,ca)),(((tl,(ga,bo)),st),bi)),out) | (-, A) | 22.3 ± 15.7 | 0.08 | 0.20 | 0.00 | 0.02 |
i ((((tp,(((tl,(ga,bo)),st),bi)),ca),lu),out) | (-, A) | 22.6 ± 15.8 | 0.08 | 0.11 | 0.00 | 0.01 |
j ((((tp,((((tl,ga),bo),st),bi)),lu),ca),out) | (A, C) | 24.0 ± 14.4 | 0.05 | 0.05 | 0.00 | 0.00 |
k ((((tp,ca),lu),(((tl,(ga,bo)),st),bi)),out) | (-, A) | 24.1 ± 15.5 | 0.06 | 0.14 | 0.00 | 0.01 |
l (((tp,(((tl,(ga,bo)),st),bi)),(lu,ca)),out) | (-, A) | 25.7 ± 15.4 | 0.05 | 0.04 | 0.00 | 0.00 |