The transcriptome of Toxoplasma gondii

Table 2 Pairwise comparisons of normalized tag frequencies for all nine SAGE libraries.

Library	SP	D4	D6	D7	D15	pH	MSJ	RH	ME49
SP	1	0.728	0.0229	0.121	0.112	0.0496	0.0557	0.022	0.0205
D4	0.728	1	0.0625	0.275	0.271	0.109	0.137	0.0554	0.0476
D6	0.0229	0.0625	1	0.0604	0.0781	0.0358	0.0486	0.785	0.343
D7	0.121	0.275	0.0604	1	0.32	0.0888	0.151	0.066	0.0809
D15	0.112	0.271	0.0781	0.32	1	0.239	0.181	0.0536	0.0623
PH	0.0496	0.109	0.0358	0.0888	0.239	1	0.119	0.0281	0.0273
MSJ	0.0557	0.137	0.0486	0.151	0.181	0.119	1	0.0348	0.0444
RH	0.022	0.0554	0.785	0.066	0.0536	0.0281	0.0348	1	0.276
ME49	0.0205	0.0476	0.343	0.0809	0.0623	0.0273	0.0444	0.276	1

Sp = sporozoite/oocyst, D4, -6, -7, -15 = days post-sporozoite infection, pH = 72 h culture of VEG strain in 8.2 pH-medium, and laboratory strains: MSJ = Type III VEG, RH = Type I, ME49 = Type II

ISSN: 1741-7007