CpG | Gene | Chrom | CpG location | P-value | FDR | logFCa | Male Avg. beta | Female Avg. beta | Sex Avg. beta difference |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
A) Placenta specific | |||||||||
cg11532947 | NAB1 | 2 | 3′UTR | 5.89E − 122 | 5.25E − 117 | 0.966 | 0.840 | 0.728 | 0.113 |
cg07355069 | HMGCS1 | 5 | 5′UTR | 7.04E − 100 | 4.71E − 95 | 1.035 | 0.926 | 0.859 | 0.067 |
cg25801066 | CALM1 | 14 | 3′UTR | 1.10E − 83 | 4.89E − 79 | 0.765 | 0.762 | 0.656 | 0.106 |
cg18090212 | APP | 21 | 3′UTR | 9.04E − 72 | 3.30E − 67 | 0.467 | 0.864 | 0.824 | 0.041 |
cg24276949 | RIC8B | 12 | 5′UTR | 1.48E − 69 | 5.16E − 65 | 0.649 | 0.784 | 0.702 | 0.081 |
cg09102486 | 5 | 1.27E − 55 | 3.09E − 51 | 0.678 | 0.608 | 0.499 | 0.109 | ||
cg17264064 | ACAA2 | 18 | 1.67E − 52 | 3.72E − 48 | 0.785 | 0.682 | 0.559 | 0.123 | |
cg00761634 | CHTF8 | 16 | 3′UTR | 6.38E − 51 | 1.35E − 46 | 0.854 | 0.930 | 0.869 | 0.061 |
cg19473894 | CCDC121 | 2 | TSS1500 | 1.00E − 50 | 2.02E − 46 | 0.680 | 0.656 | 0.556 | 0.100 |
cg11730618 | RAB7A | 3 | TSS1500 | 1.82E − 50 | 3.56E − 46 | 0.813 | 0.813 | 0.712 | 0.101 |
cg03289961 | HADHB | 2 | ExonBnd | 1.72E − 49 | 3.28E − 45 | 0.896 | 0.595 | 0.452 | 0.143 |
cg01440070 | SLC6A10P | 16 | 3′UTR | 8.10E − 47 | 1.39E − 42 | 0.818 | 0.748 | 0.636 | 0.112 |
cg17968869 | SPON1 | 11 | TSS1500 | 1.90E − 43 | 2.99E − 39 | 0.694 | 0.863 | 0.793 | 0.069 |
cg08721112 | 1 | 2.90E − 43 | 4.40E − 39 | 0.339 | 0.531 | 0.471 | 0.060 | ||
cg07285048 | 11 | TSS1500 | 4.33E − 43 | 6.44E − 39 | 0.674 | 0.913 | 0.864 | 0.049 | |
cg25667734 | TERF1 | 8 | TSS1500 | 4.92E − 41 | 7.06E − 37 | 0.683 | 0.883 | 0.823 | 0.060 |
cg11634496 | 11 | 1.09E − 39 | 1.49E − 35 | − 0.927 | 0.136 | 0.222 | − 0.087 | ||
cg02343988 | 11 | TSS200 | 1.61E − 39 | 2.16E − 35 | 0.439 | 0.653 | 0.580 | 0.073 | |
cg09779044 | CKAP5 | 11 | 5′UTR | 1.63E − 38 | 2.08E − 34 | 0.639 | 0.834 | 0.765 | 0.068 |
cg18905668 | GTF2H1 | 11 | 3′UTR | 1.21E − 37 | 1.43E − 33 | 0.418 | 0.608 | 0.537 | 0.072 |
cg15604132 | ZNF300 | 5 | TSS1500 | 1.72E − 37 | 2.00E − 33 | 1.118 | 0.569 | 0.395 | 0.174 |
cg27149150 | CAMTA1 | 1 | TSS1500 | 2.60E − 37 | 2.99E − 33 | 0.828 | 0.471 | 0.343 | 0.128 |
cg22846149 | HMGB1L1 | 20 | 2.88E − 37 | 3.26E − 33 | 0.591 | 0.626 | 0.530 | 0.096 | |
cg09914736 | CAMTA1 | 1 | 3.14E − 36 | 3.50E − 32 | 0.767 | 0.699 | 0.588 | 0.111 | |
cg22936497 | 12 | 3.39E − 36 | 3.73E − 32 | − 0.348 | 0.466 | 0.525 | − 0.060 | ||
B) Blood specific | |||||||||
cg04946709 | LOC644649 | 16 | TSS1500 | 2.23E − 89 | 7.75E − 85 | 0.752 | 0.793 | 0.703 | 0.091 |
cg07585845 | 3 | TSS200 | 1.25E − 81 | 3.81E − 77 | 0.764 | 0.725 | 0.614 | 0.111 | |
cg11284736 | HDGFRP3 | 15 | 1.10E − 80 | 3.10E − 76 | 0.686 | 0.828 | 0.753 | 0.075 | |
cg25742246 | 1 | 3′UTR | 1.04E − 58 | 2.12E − 54 | − 0.749 | 0.050 | 0.080 | − 0.029 | |
cg16021537 | RBMS1 | 2 | 1stExon | 1.14E − 53 | 1.94E − 49 | − 0.911 | 0.056 | 0.094 | − 0.038 |
cg03253995 | EIF4A1 | 17 | 5′UTR | 3.20E − 52 | 5.32E − 48 | − 0.450 | 0.436 | 0.512 | − 0.076 |
cg19311244 | 4 | 3′UTR | 7.68E − 47 | 1.08E − 42 | − 0.601 | 0.518 | 0.618 | − 0.099 | |
cg11092486 | 6 | 1.85E − 45 | 2.56E − 41 | − 0.806 | 0.371 | 0.500 | − 0.129 | ||
cg17561891 | C7orf23 | 7 | TSS1500 | 1.91E − 45 | 2.58E − 41 | − 0.441 | 0.166 | 0.210 | − 0.044 |
cg05812269 | RIOK3 | 18 | 5′UTR | 4.70E − 45 | 6.24E − 41 | − 0.460 | 0.115 | 0.149 | − 0.034 |
cg24920126 | PPP1R3G | 6 | 1stExon | 1.46E − 44 | 1.91E − 40 | − 0.994 | 0.384 | 0.548 | − 0.164 |
cg13045294 | LTBP4 | 19 | 5′UTR | 2.88E − 44 | 3.69E − 40 | − 0.611 | 0.438 | 0.538 | − 0.100 |
cg07607752 | ZPBP2 | 17 | TSS200 | 2.84E − 43 | 3.51E − 39 | − 1.142 | 0.111 | 0.203 | − 0.092 |
cg09639931 | ZPBP2 | 17 | TSS200 | 3.07E − 43 | 3.74E − 39 | − 0.951 | 0.152 | 0.249 | − 0.098 |
cg08528995 | SLC35D3 | 6 | 4.28E − 43 | 5.12E − 39 | − 1.033 | 0.705 | 0.823 | − 0.118 | |
cg05330360 | ZPBP2 | 17 | TSS1500 | 1.54E − 42 | 1.76E − 38 | − 0.508 | 0.327 | 0.404 | − 0.078 |
cg09044186 | APOA5 | 11 | 1.85E − 42 | 2.08E − 38 | − 1.263 | 0.776 | 0.883 | − 0.107 | |
cg03405128 | 4 | 3′UTR | 4.47E − 42 | 4.95E − 38 | − 0.503 | 0.304 | 0.382 | − 0.077 | |
cg21784396 | PRRT4 | 7 | 4.02E − 41 | 4.32E − 37 | − 0.963 | 0.035 | 0.061 | − 0.027 | |
cg25294504 | 20 | 3′UTR | 7.05E − 41 | 7.47E − 37 | − 0.644 | 0.673 | 0.758 | − 0.085 | |
cg26897297 | MLNR | 13 | 3′UTR | 2.48E − 40 | 2.55E − 36 | − 0.483 | 0.578 | 0.659 | − 0.080 |
cg11574745 | PPP1R3G | 6 | 1stExon | 2.84E − 40 | 2.84E − 36 | − 0.516 | 0.446 | 0.532 | − 0.086 |
cg20808136 | 15 | 2.84E − 40 | 2.84E − 36 | 0.492 | 0.853 | 0.810 | 0.043 | ||
cg07004386 | 14 | 3.85E − 40 | 3.80E − 36 | − 0.650 | 0.275 | 0.369 | − 0.095 | ||
cg08319905 | PPFIA3 | 19 | ExonBnd | 8.20E − 40 | 7.99E − 36 | − 0.313 | 0.432 | 0.487 | − 0.054 |
C) Placenta and blood overlap | |||||||||
cg26919182 | PPP1R12B | 1 | 5′UTR | 1.68E − 253 | 1.23E − 247 | − 3.004 | 0.525 | 0.894 | − 0.368 |
cg12691488 | 1 | 6.27E − 221 | 2.29E − 215 | 2.606 | 0.264 | 0.059 | 0.206 | ||
cg15228509 | 1 | 4.91E − 212 | 1.20E − 206 | − 1.684 | 0.399 | 0.670 | − 0.270 | ||
cg06513015 | ERV3-1 | 7 | 5′UTR | 1.69E − 194 | 3.09E − 189 | − 1.781 | 0.625 | 0.846 | − 0.221 |
cg00148935 | RFTN1 | 3 | 3′UTR | 2.10E − 176 | 3.07E − 171 | − 1.606 | 0.531 | 0.769 | − 0.239 |
cg09516963 | DYRK2 | 12 | TSS1500 | 3.03E − 171 | 3.69E − 166 | − 2.519 | 0.136 | 0.423 | − 0.286 |
cg11643285 | RFTN1 | 3 | 3′UTR | 1.13E − 167 | 1.18E − 162 | − 1.500 | 0.776 | 0.904 | − 0.127 |
cg03626220 | HYDIN | 16 | 2.66E − 144 | 2.43E − 139 | 0.703 | 0.680 | 0.567 | 0.114 | |
cg26355737 | TFDP1 | 13 | 4.90E − 127 | 3.98E − 122 | 0.997 | 0.888 | 0.801 | 0.087 | |
cg03226871 | 2 | 5′UTR | 3.17E − 125 | 2.31E − 120 | 0.685 | 0.605 | 0.488 | 0.118 | |
cg02716779 | DNM1 | 9 | 3′UTR | 3.08E − 124 | 2.04E − 119 | − 0.799 | 0.557 | 0.681 | − 0.125 |
cg02325951 | FOXN3 | 14 | 1stExon | 1.12E − 119 | 6.79E − 115 | 1.026 | 0.678 | 0.510 | 0.169 |
cg12607525 | UBTF | 17 | 2.30E − 119 | 1.29E − 114 | 0.589 | 0.591 | 0.490 | 0.101 | |
cg20262915 | NAB1 | 2 | 1stExon | 7.43E − 116 | 3.88E − 111 | 0.690 | 0.543 | 0.428 | 0.115 |
cg20299935 | 17 | 8.80E − 115 | 4.29E − 110 | − 0.948 | 0.622 | 0.756 | − 0.133 | ||
cg19765154 | NAB1 | 2 | 1stExon | 4.63E − 114 | 2.11E − 109 | 0.878 | 0.806 | 0.698 | 0.108 |
cg23719534 | 15 | 3′UTR | 1.40E − 110 | 6.03E − 106 | − 1.591 | 0.827 | 0.918 | − 0.092 | |
cg03618918 | 1 | 1.02E − 105 | 4.15E − 101 | 0.784 | 0.847 | 0.767 | 0.080 | ||
cg17238319 | RFTN1 | 3 | 2.33E − 105 | 8.97E − 101 | − 0.965 | 0.682 | 0.799 | − 0.117 | |
cg17232883 | 11 | 8.96E − 98 | 3.27E − 93 | − 0.802 | 0.078 | 0.125 | − 0.047 | ||
cg07852945 | TLE1 | 9 | TSS1500 | 8.89E − 85 | 2.95E − 80 | − 1.019 | 0.054 | 0.101 | − 0.047 |
cg17612569 | GABPA | 21 | 5′UTR | 4.35E − 82 | 1.38E − 77 | 1.100 | 0.078 | 0.039 | 0.040 |
cg02989351 | YWHAQ | 2 | 1stExon | 7.40E − 81 | 2.16E − 76 | − 0.644 | 0.094 | 0.138 | − 0.043 |
cg03218192 | AP2B1 | 17 | 1stExon | 4.57E − 79 | 1.24E − 74 | − 0.681 | 0.276 | 0.379 | − 0.104 |
cg09696045 | 15 | TSS1500 | 9.09E − 78 | 2.37E − 73 | − 0.412 | 0.387 | 0.458 | − 0.071 |